01从图像到性状
搭建植物表型工作流
先掌握可复现的图像分析，再引入基础模型分割，最后在真实田间数据上完成评测。
- PlantCV
- Meta SAM 3.1
- PhenoBench
科研学习资源中心精选并核验 · 2026 年 7 月
学习 AI for Science 与数字农业。
围绕科学机器学习、智能体与大模型、作物模拟、植物表型、遥感与三维重建，精选官方课程、模型、数据集和工具。
- 项精选资源
- 73
- 个聚焦主题
- 8
- 来源原则
- 官方优先
- 最近核验
- 2026 年 7 月
从目标出发
三条可执行的学习路径
每条路径都从可靠起点出发，逐步进入可复现的科研工作流。
02从过程到预测
学习过程机理作物模型
从易上手的水分生产力模型开始，逐步进入 Python 工作流与完整农作系统模拟。
- FAO AquaCrop
- PCSE / WOFOST
- APSIM Next Generation
03从叶片到冠层
把光合测量做扎实
先补上生理背景，再按公认协议完成测量，最后用 R 可复现地分析气体交换数据。
- Plants in Action
- PROMETHEUS Protocols
- Photosynthesis with R
04模型结合机理
进入 AI for Science
先建立领域知识地图，再学习科学机器学习，最后通过官方 Notebook 复现领域模型。
- AI for Science 101
- MIT SciML
- NVIDIA PhysicsNeMo
精选目录
找到合适的学习资源
先在左侧选择维度——基础、领域或表达发表，再在每个主题内由入门读到高级。
显示 73 / 73 项资源
基础能力
深度学习、图学习、经典机器学习，以及值得反复回看的从零讲解。
入门
PyTorch Foundation官方
更新于 2026PyTorch Tutorials
从张量和训练循环到迁移学习、目标检测、分布式训练与编译优化的官方学习路径。
- Deep learning
- Python
- Computer vision
Inria / Scikit-learn官方
Scikit-learn MOOC
严谨介绍表格机器学习、评估、流水线、模型选择与避免数据泄漏的实验方法。
- Classical ML
- Evaluation
- Pipelines
Andrej Karpathy社区
更新于 2026Neural Networks: Zero to Hero
从零手写神经网络：反向传播、makemore 与 GPT，配套逐行讲解的可跟练视频课程。
- From scratch
- Backprop
- GPT
3Blue1Brown社区
更新于 20263Blue1Brown: Neural Networks
以可视化和直觉优先的方式讲解神经网络、梯度下降、反向传播与 Transformer。
- Intuition
- Visualization
- Math
MIT 6.036 / 6.390官方
MIT Introduction to Machine Learning
覆盖回归、分类、神经网络与强化学习的完整讲义，适合在视频课程节奏过快时对照阅读。
- Notes
- Fundamentals
- Math
进阶
智能体与大模型
模型 API、智能体框架、工具协议与农业领域模型。
入门
Anthropic官方
更新于 2026Anthropic Claude Docs
Claude 官方开发文档，涵盖 Messages API、工具调用、扩展思考、结构化输出、提示缓存与智能体模式。
- LLM API
- Tool use
- Prompting
OpenAI官方
更新于 2026OpenAI Platform Docs
OpenAI 官方开发参考，涵盖 Responses API、函数调用、结构化输出、向量嵌入与检索。
- LLM API
- Function calling
- Embeddings
Hugging Face官方
更新于 2026Hugging Face Agents Course
系统的智能体实战课程，基于 smolagents、LlamaIndex 与 LangGraph，从基础一直做到综合项目。
- Agents
- Hands-on
- Frameworks
进阶
Anthropic官方
更新于 2026Claude Agent SDK
基于与 Claude Code 相同的运行时构建生产级智能体，支持子代理、会话、工具编排与 MCP。
- Agents
- Python & TS
- MCP
OpenAI官方
更新于 2026OpenAI Agents SDK
轻量的多智能体编排框架，支持代理交接、护栏、会话与内置追踪。
- Agents
- Orchestration
- Tracing
MCP Project官方
更新于 2026Model Context Protocol
连接大模型与工具、数据源的开放标准，拥有不断增长的可互操作服务器生态。
- Interoperability
- Tools
- Standard
Hugging Face官方
更新于 2026smolagents
极简的代码型智能体库，定义工具、接入任意模型，几行 Python 即可运行智能体循环。
- Code agents
- Lightweight
- Python
Shanghai AI Lab官方
更新于 2024SeedLLM 丰登
首个种业大语言模型，围绕品种选育、农艺性状、栽培技术与适宜推广区域进行专业训练。
- Agri LLM
- Breeding
- Chinese
高级
LangChain官方
更新于 2026LangGraph
面向持久化、有状态多智能体系统的底层编排框架，支持显式图结构、记忆与人类参与环节。
- Stateful agents
- Graphs
- Python
AgriAgent (open source)社区
更新于 2024AgriAgent
基于 MiniCPM-Llama3-V 的中文开源农业多模态大模型，可进行作物病害识别与种植问答。
- Agri VLM
- Disease ID
- Chinese
AgriGPT (arXiv)社区
更新于 2025AgriGPT
面向农业的领域大模型生态，基于多智能体数据引擎与 Agri-342K 指令数据集构建。
- Agri LLM
- Dataset
- Ecosystem
植物生理与测量
光合、荧光与冠层测量协议，以及仪器数据的分析方法。
入门
Australian Society of Plant Scientists官方
Plants in Action
开放的植物生理学教材，涵盖光合、水分关系、生长与逆境，是模型或影像类论文默认你已具备的背景知识。
- Textbook
- Photosynthesis
- Water relations
PrometheusWiki community官方
PROMETHEUS Protocols
由社区维护的气体交换、荧光、传感与环境测量协议，写法上强调他人可复现同一方法。
- Protocols
- Gas exchange
- Sensing
PhotosynQ官方
PhotosynQ
MultispeQ 手持设备配合共享协议与数据，可在田间获取荧光与叶片测量，无需实验台。
- MultispeQ
- Fluorescence
- Field
进阶
Jiedong Zhu (bookdown)社区
Photosynthesis Data Analysis with R
中文实操指南，讲解如何在 R 中拟合 A/Ci 与光响应曲线，并整理 LI-COR 仪器数据。
- R
- A/Ci curves
- Chinese
LI-COR Environmental官方
LI-6800 Photosynthesis System
多数光合论文所依赖的气体交换与荧光系统的手册、应用笔记与配置说明。
- Gas exchange
- Instrument
- Manuals
METER Group官方
Researcher's Guide to Leaf Area Index
讲解 LAI 的定义、直接与光学测量方法及各自误差来源，在采信 LAI 产品前值得一读。
- LAI
- Canopy
- Measurement error
高级
JB Hyperspectral Devices官方
FloX SIF Monitoring
对日光诱导荧光与反射率的连续田间观测，是冠层尺度 SIF 研究的地面参考。
- SIF
- Hyperspectral
- Canopy
作物模型
过程机理作物模拟：从易上手的水分模型到完整农作系统与虚拟植株。
入门
进阶
高级
APSIM Initiative官方
更新于 2026APSIM Next Generation
在成熟的农业系统框架中模拟土壤、水分、氮素、作物、轮作与管理情景。
- Systems model
- Scenario analysis
DSSAT Foundation官方
更新于 2026DSSAT Cropping System Model
学习品种—土壤—天气—管理耦合模拟，用于产量预测、品种参数校准和气候风险研究。
- Yield
- Calibration
- Climate risk
Cropbox官方
Cropbox.jl
用于构建、校准、评估和可视化作物及生理模型的 Julia 声明式框架。
- Julia
- Model development
- Experimental
Plant Simulation Lab, UC Davis官方
Helios
基于 C++ 的三维植株结构框架，支持光线追踪辐射、能量平衡、光合模拟与合成影像生成。
- 3D canopy
- Ray tracing
- C++
LESS developers官方
LESS
大尺度三维辐射传输模型，可在真实冠层上模拟反射率、热红外影像、LiDAR 与 SIF。
- Radiative transfer
- LiDAR
- Simulation
植物表型
从图像到性状的工作流、分割模型、田间基准，以及背后的元数据标准。
入门
IPPN官方
International Plant Phenotyping Network
表型领域的伞式网络：工作组、平台设施、活动信息，以及一份可靠的领域人员与机构地图。
- Community
- Facilities
- Events
进阶
Donald Danforth Plant Science Center官方
更新于 2026PlantCV
面向 RGB、NIR、热红外、荧光、高光谱、形态和地理空间影像的可复现植物分析流程。
- Python
- Image analysis
- Hyperspectral
PhenoCam workflow官方
PhenoAI
专注 PhenoCam 时序影像质控、植被分割、植被指数与物候参数提取的工作流。
- Phenology
- Time series
- DeepLabV3+
Kreshuk Lab官方
更新于 2025PlantSeg v2
基于 Napari 的二维与三维细胞分割工具，针对高密度植物组织和显微影像优化。
- Microscopy
- 3D cells
- Napari
Open3D官方
Open3D Tutorials
覆盖点云、网格、RGB-D、配准、重建和三维机器学习的 Python/C++ 教程。
- Point cloud
- Mesh
- 3D vision
Breeding API community官方
BrAPI
面向育种与表型数据的通用接口标准，使试验、种质与观测数据在系统间流转无需定制导出。
- API
- Breeding data
- Interoperability
ELIXIR / EMPHASIS官方
MIAPPE
植物表型试验的最小信息标准清单；应在采集时就落实，而不是等审稿人提出要求。
- Metadata
- FAIR data
- Checklist
高级
University of Bonn / PhenoRob官方
更新于 2026PhenoBench
基于 UAV 田间影像的作物、杂草、植株实例、叶片实例与层次全景分割基准。
- UAV
- Segmentation
- Codabench
ICRISAT官方
更新于 2025ICRISAT Legume 3D Point Clouds
四类豆科作物的多光谱三维扫描数据，含叶片、叶柄、茎器官标签与 MIAPPE 元数据。
- Point cloud
- Organ labels
- MIAPPE
Meta Research官方
更新于 2026Meta SAM 3.1
支持文本概念提示的图像与视频检测、分割和跟踪，提供 Notebook 与微调代码。
- Segmentation
- Tracking
- Foundation model
John Innes Centre官方
MorphoGraphX
用于四维活体组织、细胞几何、生长、荧光信号与形态发生的可视化和定量分析。
- 4D imaging
- Morphogenesis
- Cells
University of Bonn / StachnissLab官方
Pheno4D
玉米与番茄的时空点云数据，带叶片实例标注，是四维植株生长分析中少见的基准数据。
- Point cloud
- 4D growth
- Instance labels
GeoAI 与三维
地球观测平台、地理空间基础模型、摄影测量与点云工作流。
入门
European Space Agency官方
更新于 2026ESA WorldCereal
全球作物范围与类型制图平台，提供 MOOC、参考数据、Notebook 和在线处理中心。
- Global crops
- MOOC
- Processing hub
FAO官方
FAO SEPAL Classification
用于影像镶嵌、训练样本采集及 RF/SVM/梯度提升土地与作物分类的低代码流程。
- Low code
- Sentinel
- Classification
QGIS Project官方
QGIS User Guide
在进入脚本化空间分析之前，先掌握投影、矢量栅格处理与制图排版的实用入口。
- GIS
- Projections
- Cartography
进阶
Google Earth Engine官方
更新于 2025AlphaEarth Satellite Embeddings
用于少样本分类、聚类、土地覆盖和农业制图的年度预计算地球表征。
- Embeddings
- Few-shot
- Earth Engine
WorldCereal / open community官方
更新于 2026Fields of The World
提供全球农田边界数据、预训练分割模型、CLI、QGIS 工具与浏览器推理。
- Field boundaries
- Segmentation
- QGIS
Google for Developers官方
Google Earth Engine Tutorials
面向行星尺度影像、时序、分类与导出的官方 JavaScript 和 Python 学习路径。
- Geospatial
- JavaScript
- Python
OpenDroneMap Community官方
OpenDroneMap
将无人机影像处理为正射影像、点云、DSM/DTM、多光谱产品与纹理三维模型。
- UAV
- Photogrammetry
- Point cloud
高级
IBM / NASA / TorchGeo官方
更新于 2026TerraTorch + Prithvi-EO-2.0
微调开放地理空间基础模型，用于多时相分类、分割与作物制图。
- Earth observation
- HLS
- Foundation model
NASA Harvest官方
更新于 2026NASA Harvest Presto
融合 Sentinel-1/2、气象与地形信息的轻量自监督时序 Transformer，适合少样本作物制图。
- Time series
- Few-shot
- Crop mapping
NASA Earthdata官方
NASA ARSET: ML for Agriculture
使用 Sentinel-2、作物标签、云端数据工程与 TensorFlow 的完整农业遥感机器学习流程。
- Remote sensing
- Cloud
- Crop classification
AI for Science
科学机器学习、物理约束模型与可运行的领域基础模型。
入门
AI4Science101 Community社区
AI for Science 101
覆盖图学习、分子模拟、因果机器学习、结构生物学与量子科学的可读知识地图。
- Field map
- Reading
进阶
DeepChem官方
更新于 2026DeepChem Tutorials
通过 Notebook 学习分子性质预测、药物发现、量子化学和材料科学机器学习。
- Molecules
- Materials
- Notebooks
Google DeepMind官方
AlphaFold Server & Database
通过官方数据库探索蛋白结构，并使用 AlphaFold 3 服务测试生物分子相互作用。
- Structural biology
- Protein
FutureHouse官方
更新于 2026PaperQA2
带引用依据的科研文献检索与问答工作流，也可接入本地模型。
- Literature
- RAG
- Research agents
高级
MIT 18.337官方
更新于 2026MIT Parallel Computing & SciML
系统讲解自动微分、ODE/PDE 求解器、PINN、概率编程、GPU 与高性能计算。
- PINN
- Differential equations
- HPC
NVIDIA官方
更新于 2026NVIDIA PhysicsNeMo
面向神经算子、PINN、MeshGraphNet、天气、流体和分子系统的工程级 Physics AI 教程。
- Physics ML
- Neural operators
- Python
Chan Zuckerberg Biohub官方
更新于 2026Biohub ESM
当前维护的 ESM 蛋白语言模型代码，覆盖表征提取、结构预测与蛋白互作研究。
- Protein LM
- ESMC
- ESMFold2
Microsoft Research AI for Science官方
更新于 2026Microsoft Aurora
面向天气、空气质量、海浪与热带气旋的地球系统基础模型，附官方 ERA5 示例。
- Earth systems
- Weather
- Foundation model
写作与图表
论文语言、规范术语，以及可以直接借鉴的图表范例库。
入门
University of Manchester官方
Academic Phrasebank
按论文章节组织的学术英语句式库，是卡在引言或讨论部分时最快的解法。
- Academic English
- Sentence patterns
Purdue University官方
Purdue OWL
由大学写作实验室维护的语法、文体与引用格式参考，质量远高于一般内容站点。
- Grammar
- Citation
- Style
Overleaf官方
Overleaf Templates
可在浏览器直接编译的期刊、学位论文、简历与海报 LaTeX 模板，从可用文档起步而非空白导言区。
- LaTeX
- Templates
- Manuscripts
Yan Holtz社区
From Data to Viz
从数据类型出发的图表选择决策树，并逐一指出每类图表常见的误用。
- Chart choice
- Caveats
- R & Python
进阶
Planteome Project官方
Planteome
植物性状、解剖结构与生育期的参考本体；采用这些术语可让数据在不同物种间保持可检索。
- Ontology
- Traits
- Terminology
Yan Holtz社区
The R Graph Gallery
数百个带可复现代码的 ggplot2 图表范例，把脑中的构图快速变成可发表的图。
- ggplot2
- R
- Reproducible code
Apache Software Foundation官方
Apache ECharts Examples
可在线编辑的交互图表示例，适合图表需要放在网页或看板而非 PDF 中的场景。
- Interactive
- Web
- Dashboards
