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成像与视觉

根系图像预处理器

浏览器版 RootQuantify:圈出根系区域,用形态学闭运算去除背景,按原始分辨率阈值分割,再手动修正。

  • 与 RootQuantify 一致
  • 原始分辨率
  • PNG 导出
稳定版本 2026.10.2验证于 2026-10-14与桌面版 RootQuantify(RootImager.py)处理完全一致。在 403 张测试扫描图(最大 6000 × 8000 px)上,结果的每个像素(含多边形掩膜)都与用 OpenCV 4.14 和 5.0 运行的 RootQuantify 相同(约 2 亿像素);浏览器中 PNG 与 JPEG 输入的结果同样一致。

处理工作区

浏览器版 RootQuantify:圈出根系区域,按原始分辨率执行背景扣除和阈值分割,再手动修正。

上传根系的 JPG/PNG 扫描图即可开始。

原图预览

只读

ROI / 处理画布

点击添加多边形顶点

ROI 多边形

在右侧画布上点击,圈出根系所在区域。

点数: 0未闭合

自动处理

对 ROI 执行 RootQuantify 的处理:形态学闭运算估算背景、相减、最小-最大归一化、阈值分割。结果为 ROI 外接矩形内白底黑根的图像,与桌面版保存的一致。

手动修整

自动处理后,切换到手动模式,用画笔和撤销功能修整细节。

导出

引用本工作​

如果你在研究中使用了数字植物表型平台 v25.0 或其中的任一工具,请引用。

DOI10.5281/zenodo.17544584
APA

LiangchaoDeng. (2025). smiler488/smiler488.github.io: Digital Plant Phenotyping Platform v25.0 (v25.0.0). Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.17544584

BibTeX
@software{Deng2025_DPPP_v25,
  author       = {Deng, Liangchao},
  title        = {Digital Plant Phenotyping Platform (v25.0)},
  year         = {2025},
  publisher    = {Zenodo},
  doi          = {10.5281/zenodo.17544584},
  url          = {https://doi.org/10.5281/zenodo.17544584},
  note         = {[Computer software]}
}

在 Zotero 中打开“文件”菜单,选择“从剪贴板导入”。

参数记录​

本工具的每次导出都会生成一份记录,包含参数设置、工具版本与文件校验值,便于日后复现结果。

本次会话尚未导出。

下一步可以用​

能接收本工具输出结果的工具。